Ngành vận chuyển đường thủy ngày càng quan tâm đến bảo vệ môi trường. Các công ty vận chuyển đường thủy thường có chính sách và quy định về việc giảm thiểu ô nhiễm môi trường, sử dụng nhiên liệu tiết kiệm năng lượng và thực hiện các biện pháp bảo vệ môi trường trong quá trình vận chuyển.